至于南京那边的形势，也与郑锦去年离开时相比，有了较大的变化。
当初南京被收复的消息传回北京城后，一时京师大震，东南之客，皆热血思归，至有泣下者。
顺治帝福临更是惊惶失措，西方传教士汤若望叙述当时的情况说：皇帝完全失去了他镇静的态度，而颇想作逃回满洲之思想。
可是孝庄皇太后（1613年－1688年）向顺治帝大加叱责，她说：
陛下怎么可以把他的祖先们以他们的勇敢所得来的江山，竟这么卑怯地放弃了呢？
顺治帝一听皇太后的这话，这时反而竟发起了狂暴的急怒，
他拔出他的宝剑，并且宣言为他决不变更的意志，要亲自去出征，或胜或死。
为坚固他的言词，他竟用剑把一座皇帝御座劈成碎块。
他还说只要有谁敢对于这御驾亲征的计划说出一个不字，便形如御座！
孝庄皇太后大惊，她虽说坚决不肯放弃祖宗打下的江山，但也决计不愿让皇帝御驾亲征。
于是她百般尝试着用言词来平复皇帝底这暴躁，另派皇帝以前的奶母到皇帝面前进劝，可是这更增加了顺治帝的怒气。
顺治帝完全不理会孝庄皇太后的劝谏，让各城门贴出了官方的布告，晓谕人民，皇上要亲自出征，登时全城内便起了极大的激动与恐慌。
去年的九月，就在郑锦被迫离开南京，返回厦门的时候，顺治帝驾幸海子（指北京供皇帝游猎的南海子），整饬六师亲征。
历史上顺治皇帝福临也曾有过这样的作态，只是不久后，江南巡抚蒋国柱便上奏捷报，说郑贼已破。
所以顺治帝的御驾亲征计划便没能实行，欣欣然的摆驾回宫，传百官于午门宣捷。
但在本时空，顺治帝皇帝的运气就没那么好了，
因南京城被郑军攻下，四周的城县望风而降，郑军以南京城为重心，已有了坚实的立足点，自然不会再重复历史上屯师于敌城之下，等清方援军汇集后，一击即溃的局面。
在郑锦离开后，郑成功利用清军主力稍微到来的时间，又或出兵或说降了镇江府与苏州府之间的常州府，且攻取了苏州府的常熟、镇海卫、嘉定。
基本上整个苏州府，就仅剩下一座苏州城仍在坚守而已。
再加上此前早已被郑锦出兵攻下的丹阳、句荣、秣陵关这些战略要地，南边的援军基本可以轻松阻挡在外。
所以郑成功便将防范的主要精力，放在了江北之地。
去年十月初八，清廷命内大臣达素为安南将军，同固山额真索洪、护军统领赖达等统领官兵征剿海逆郑成功。
同时，顺治帝也力排众议，御驾亲征，统率六师押后而行，他本人也是入关后第一次到了黄河以南。
不过当他的御驾抵达黄河边上的重镇徐州（此时黄河是夺淮入海，因此徐州在黄河边上）后，洪承畴的奏疏却八百里加急赶到。
洪承畴在奏疏上倒是没有直言劝谏顺治帝不可御驾亲征，而是劝他不要到前线去，在徐州督战即可。
洪承畴开诚布公的说，天子六师都是由清贵子弟组成，平时甚少操练，实在难堪一战，
天子若是在前线战败，局面将难以挽回，而等出征云南的主力回援后，胜算则会大为增加。
这些都是大实话，由不得顺治帝不仔细权衡。
与此同时，随行的文武大臣也一同苦劝，顺治帝福临这才同意了洪承畴的提议，让达素统兵继续南下，
另外，顺治帝还让漕运总督亢得时出师高邮，往援南京近左的城池，
然而亢得时早已闻风丧胆，认为不死于敌必死于法，索性在途中从船上跳入水中自尽了，给清军的士气造成了极大的负面影响。
总之，现在这个时间点，清军南征云贵的主力已有一部分开始班师回援，只是因连番大战，颇为疲惫，且路途遥远，需一路休整，所以暂时尚未抵达战场。
而顺治帝虽然已经高举御驾亲征的旗帜，一定程度上激励了士气、振奋了清方人心，但因兵力不足，还不太敢朝南京大举进攻。
江北之地，反而是郑军主动出击的多一些。
而南边的浙江、江西、福建方向的清军，则受阻于丹阳等坚城，日益困窘。
特别是征调自福建的清军，因郑锦近来在福建沿海一带动作频频，担心后院起火，又见前进无望，只好匆匆撤了回去。
所以短时间内，南京那边的局势基本可以无忧，
只是若是不能再乘这难得的时机将局面再打开一些，比如攻下杭州城、巩固后方，又或是夺取扬州重镇江都，以便更好的防守，
一旦等到前往云贵的清军主力返回并休整完毕，郑军的日子就不会好过了。
此外，现在清军在大肆宣传永历朝廷已经覆灭一事，还谣传永历帝已被他们生擒，对南京内外军民造成了极不利的影响。
永历帝不管怎么说，都是此时的大明共主，
且在大明的皇室继统问题上，现在最正统的便永历帝所在的桂藩一系。
因为在明末的宗室中，同崇祯皇帝朱由检最亲的是他的祖父明神宗皇帝（万历帝）的子孙，即福、瑞、惠、桂四藩王。
瑞王朱常浩原封陕西汉中，1643年李自成军攻入潼关，朱常浩逃到四川重庆；次年张献忠军攻克重庆，朱常浩全家被杀，端王系绝嗣。
而福王朱常洵之子朱由崧，即之前的弘光帝。
惠王朱常润原封荆州，当农民军暴席卷湖广时，他经长沙、衡州逃到广西，弘光在位时移住浙江嘉兴。
1645年六月清军迫近杭州，监国潞王朱常淓投降，惠王朱常润和周王、崇王也在清军统帅博洛招诱下降清，被押送到北京，后来同弘光帝朱由崧，监国潞王朱常淓等一道处死。
如此一来，到了1645年的六月以后，神宗皇帝的子孙剩下的只剩下桂藩了。
所以若是永历帝果真被清军俘获，大明正统就算是彻底的断绝了，再想另寻他人继位，就只能寻一些旁枝末系，这对复明事业无疑是一大打击，对人心的影响也是巨大的
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