像所有父亲是神明的英雄一样，珀尔修斯一开始就得到父亲宙斯的帮助。
最初这个男孩什么也没有准备好就匆匆上路，因此不久就走进了迷途。不过他没有忘记母亲常常念叨的自己的身世，于是珀尔修斯就跪下来，向那个西方远古的众神之神宙斯祈祷。
儿子有难，做父亲的自然很容易地接受到了信息，宙斯于是派出了自己的信使赫尔墨斯。
赫尔墨斯很快就到了珀尔修斯身边，给了他一双会飞的鞋。西方的神明不具备腾云驾雾的功夫，但作为信使的赫尔墨斯就有这么一双鞋。
当然，聪明的珀尔修斯不止只需要一双鞋子，他的父亲既然已经派了人来帮助自己，他就向父亲的仆人要求自己还需要的东西。
“你还要什么？”赫尔墨斯问。
“能杀死美杜莎的武器，还要盾牌，头盔和铠甲！”珀尔修斯说。
“这个，我来时主神已经吩咐过了，你可以找水神宁芙，这个宁芙会给你你需要的东西！”
“宁芙究竟在那儿？”
“不知道，不过，你可以去找格里伊三姐妹。至于这三姐妹的住址，那是大多数人都知道的！”
赫尔墨斯走了，珀尔修斯穿上了他留给自己的鞋子，还真的随意就能够很快速地在空中飞腾。
找到这三姐妹并不难，她们却远离人类，住在一个阴冷潮湿的孤岛上。三姐妹一出生就是又老又丑的老太婆，因此她们远离人类，就是远离讥讽和不屑。三姐妹的生活全靠好心的宁芙照料着，因此她们知道这个宁芙究竟藏身哪里。
珀尔修斯其实很有智慧，他没有贸然就去找那三个老太太，而是悄悄潜入岛里，暗中观察她们的弱点。
原来命运对那三姐妹也太不公了，她们不止又老又丑，她们还是三个瞎子。三个人只能凭借宁芙给予她们的一颗眼珠，才能看清这个世界。她们每天一人地轮流着使用那只眼珠子，大姐传给二姐，二姐传给三妹。
那一天三妹把眼珠从眼眶中掏出，传给三妹时，暗中靠近她们的珀尔修斯突然出手，从三妹手里抢下了眼珠。
三姐妹立即陷入了惊恐和黑暗。
她们只有按照珀尔修斯的要求，把宁芙的住地和盘托出。
在冥河边通往地狱的路上，珀尔修斯很快就找到了宁芙。
宁芙问清楚了珀尔修斯的经历和来找他的原因。
“你为了杀人来找我，本来是不该支持你的，可是今天你却是为拯救而来，我一定要成全你！”
“我在拯救？”珀尔修斯不解。
“是的，从你那个方面说，你要让你的母亲脱离暴君的强迫，那是拯救；对那些怀着不同的目的寻找美杜莎的人来说，你让许许多多的人从此不再化为石头，那是拯救；而对于美杜莎而言，生不如死却欲死不能的日子走上了终结，那也是拯救。
宁芙给了珀尔修斯一把剑，一块盾牌，一副铠甲，一个头盔。
宙斯剑，雅典娜盾牌，还有冥王哈迪斯的头盔和铠甲。
珀尔修斯完成了准备，决战开始。不，是拯救开始。
她很快就飞到美杜莎被流放的岛上，岛上站满了奇奇怪怪的人形状的石头，然后一步步走向了石头阵的中心。
珀尔修斯心里忐忑着，他不是走，而是一步步后退。他举起了手中的盾牌，利用盾牌上的投影搜寻美杜莎的所住。
“这就对了，你千万别看我，慢慢看着盾牌上我的影子走过来，一步一步走过来！”珀尔修斯听到身后传来了声音，心里更加慌乱。
这时他看到了盾牌里上美杜莎的影子，这个影子在石头阵的中心静静地站着，一脸凶相，丑陋不堪，一团蛇在头上蠕动。
“你就这么过来，千万别回头，我这双该死的眼睛真的闭不了。杀了我后也千万不要看我的眼睛，这个头颅也要深埋，算是我求你了！”美杜莎又吩咐说。
珀尔修斯小心翼翼地后退着。
“你真的不怕死？”他问到，显然，这时的珀尔修斯有些犹豫要不要杀死这个自己历尽千辛寻找到的人。
“我在求死！你快些呀！”
珀尔修斯从盾牌的反光中看到了真心的祈求。
他后退着，靠近了。美杜莎一动不动。珀尔修斯闭上了眼睛，然后把手中的宙斯剑挥出。
咚的一声，那是一颗头颅在往地上滚落。
落在地上的头颅还在竭尽全力地喊了一句：“不要看到我的眼睛，它还是闭不了呀！”
珀尔修斯背对着那颗头颅，他的前面是美杜莎的尸体。没有了头颅的美杜莎手里握着以个口袋。
珀尔修斯依旧利用那面盾牌的反光，找到了美杜莎的头，然后小心翼翼地把那颗滴着血的头颅塞进了口袋中。此时，头颅上的蛇已经死亡，不再蠕动。
珀尔修斯提着口袋就走，美杜莎的头颅在往下地上滴血，一滴就是一丛杜鹃花。
当珀尔修斯飞回塞里福斯岛时，他的母亲正在被逼迫着与那个当地的统治者举行婚礼，而新娘的父亲也漂洋过海地被从遥远的地方请来。
国王要卫士赶走珀尔修斯。
“可是我已经为你砍下了那颗头颅”珀尔修斯喊。
“不可.......”
国王的“能”字还未发出，珀尔修斯已经把手探进了口袋里，把美杜莎的头提起，面向着国王。
国王在一声惊愕中立即凝固，成了一块丑陋的怪石。坐在国王身边的珀尔修斯的外公也没有幸免，他从里到外一下子石化，还真就走进了“要被女儿的儿子杀死”的预言中。
珀尔修斯怕伤害更多的人，赶忙把美杜莎的头颅塞进了口袋，然后与自己的母亲相拥而泣。
后来珀尔修斯成了这塞里福斯岛上的王，也很快就继承了他外公的王位。
他真的把美杜莎的头颅深埋了。
差不多两千多年后，基督教传到了西方。那个基督教里的魔鬼撒旦也跟着前往。他用他那双邪恶的眼睛看清了美杜莎那颗头颅依然没有腐烂，于是将其掘出，准备用它的力量称霸世界。